O prestup do tried Evanjelickej základnej školy a Evanjelického lýcea je možné požiadať riaditeľku školy. Prestup sa spravidla uskutočňuje do 15. septembra v danom školskom roku (uzávierka štatistík pre daný šk. rok). Vo výnimočných prípadoch je prestup možný aj v priebehu školského roka, najlepšie pri uzavretí klasifikačného obdobia.

Na základe žiadosti zákonných zástupcov žiaka / prípadne plnoletého žiaka a po zvážení predchádzajúceho prospechu uchádzača a voľných miest v triede rozhodne riaditeľka školy o prestupe žiaka.